Ο Σκούμπι – Ντου, ο Σάγκι και η παρέα της Μυστήριο Α.Ε. στην πιο εξωγήινη περιπέτεια! Όταν η παρέα καταλήγει σε μια απομονωμένη εγκαταλελειμμένη πόλη, ανακαλύπτούν ότι είναι γεμάτη ιπτάμενους δίσκους, περίεργους επιστήμονες… και όχι και πολύ φιλικούς εξωγήινους! Και αφού γλιτώνουν από το κυνήγι με τους εξωγήινους και μια απαγωγή, ακόμα πιο περίεργα πράγματα συμβαίνουν στον Σκούμπι Ντου και τον Σάγκι καθώς ερωτεύονται και οι δυο κεραυνοβόλα! Σε μια άκρως απόρρητη κυβερνητική ερευνητική βάση κρυμμένη σε ένα τεράστιο υπόγειο δίκτυο σπηλαίων κάτω από την έρημη πόλη, οι ερωτοχτυπημένοι φίλοι μας με την παρέα τους ξεκινούν έναν αγώνα δρόμου για να λύσουν το μυστήριο...