Όταν ο τεσσάρων ετών Κουν συναντά την νέα του μικρή αδελφή, ο κόσμος του έρχεται τα πάνω-κάτω. Ονόματι Μιράι (που σημαίνει «μέλλον»), το μωρό γρήγορα κερδίζει τις καρδιές όλης τής οικογένειας του Κουν. Καθώς η μητέρα του επιστρέφει στην δουλειά και ο πατέρας του προσπαθεί να τα βγάλει πέρα με το σπίτι, ο Κουν αρχίζει να ζηλεύει ολοένα και περισσότερο την μικρή Μιράι... ώσπου μία μέρα τρέχει στην αυλή του όπου συναντά μία παράξενη καλεσμένη από το παρελθόν και το μέλλον-την αδελφή του Μιράι, ως έφηβη. Μαζί ο Κουν και η έφηβη Μιράι παν σε ένα ταξίδι στον χωροχρόνο, αποκαλύπτοντας την απίστευτη ιστορία τής οικογενείας τους. Αλλά, γιατί ήρθε η Μιράι από το μέλλον;